מרפאה לטיפול בדיכאון ואובדנות - במרכז שניידר פועלת מרפאה ייחודית לטיפול בדיכאון ולמניעת אובדנות בקרב בני נוער. זו תכנית יחידה מסוגה בישראל, המתמקדת באבחון וטיפול בילדים הסובלים מדיכאון, וכן במחקר קליני. היחידה מטפלת בכ150 - ילדים ומתבגרים בכל שנה. בכל חודש מגיעות 25 הפניות חדשות כאשר זמן ההמתנה לטיפול עומד עלכשנה בשל מגבלות תקציביות למימון מטפלים. בנוסף, בכל שנה נבדקים במיון כ- 100 צעירים לאחר ניסיון אובדני, ללא מענה מיטבי. על כן, החליט מרכז רפואי שניידר לייחד מרכזלטיפול בדיכאון ומניעת אובדנות  שייתן טיפול מקיף למתבגרים במשבר ומשפחותיהם, יקיים מחקר על התערבויות קצרות מועד לטיפול בדיכאון בילדים (על מנת לקצר זמני המתנה ארוכים לטיפול) ויעסוק בהכשרה של צוות מקצועי לעבוד עם צעירים אובדניים.

מרפאה לטיפול בהפרעות אכילה - צוות המרפאה מאבחן ומטפל בילדים ובני נוער הסובלים מהפרעת אכילה כגון אנורקסיה, בולימיה, התקפי אכילה בלתי נשלטים ואכילה סלקטיבית. הטיפול הרב-מקצועי מתמקד בפן הרגשי, המשפחתי, הרפואי והתזונתי. בנוסף מתקיים מחקר על ההיבטים השונים של ההפרעה ושיטות הטיפול בה. נאמני מרכז שניידר תומכת במשרות של צוות המרפאה הכולל פסיכולוגיות קליניות ורפואיות, דיאטניות קליניות, פסיכיאטרים, מטפלת בהבעה ועובדות סוציאליות.

מרפאה לטיפול בהפרעות טיקים ובתסמונת טורט - המרפאה במרכז שניידר הינה מרפאה ייחודית בישראל לאבחון וטיפול בילדים עם הפרעות טיקים ותסמונת טורט. צוות המרפאה הינו רב מקצועי כולל פסיכיאטרים, נוירולוגים ופסיכולוגים. שירותי המרפאה כוללים: הערכה רב־תחומית, טיפולים ייחודים התנהגותיים לשליטה בטיקים, טיפול קוגנטיבי־התנהגותי, ביופידבק, אימון לשינוי הרגלים, הדרכת הורים וטיפול תרופתי. אוכלוסיית היעד של התוכנית - מטופלים הסובלים מהפרעות טיקים ותסמונת טורט. הטיקים מסבים לילדים ולמתבגרים סבל רב. הסבל נובע ראשית מאי הנוחות שבטיקים עצמם - כאב מביצוע הטיק, פציעת הגוף עקב טיקים, וירידה ביכולת הקשב ללימודים או לפעילויות תואמות גיל אחרות; ושנית  מתשומת הלב של הסביבה לטיקים. העלולה להוביל  להקנטות, סטיגמה או אף לדחייה חברתית.